藥學部下設門診西成藥房、中草藥房、小包裝飲片藥房、中藥配方顆粒藥房、住院藥房、急診藥房、感染性疾病科藥房、骨傷醫(yī)療中心藥房、社區(qū)藥房、科研藥房、藥庫、煎藥室、臨床藥學室。

　　近年來藥學部注重規(guī)范化管理，旨在提升內涵建設;注重員工繼續(xù)教育、崗位練兵，旨在提升自身專業(yè)素質;注重藥師參與臨床工作，旨在發(fā)揮藥師在保證合理用藥中的作用;注重藥學文化建設，旨在增加藥師凝聚力和對本職工作的熱愛。

　　近3年來，藥學部共承擔省部級課題5項，院級課題9項，參與國家級課題1項，省部級課題5項，發(fā)表論文30余篇，主編及參編論著8部。

　　近年來科室建設方面獲得榮譽：

　　? 2015年中華全國婦女聯(lián)合會“全國三八紅旗集體”榮譽稱號

　　? 2015年國家中醫(yī)藥管理局“巾幗建功先進集體”榮譽稱號

　　? 2015年國家衛(wèi)計委“改善醫(yī)療服務創(chuàng)新亮點優(yōu)質服務崗”

　　? 2014年中央國家機關團工委“五一勞動獎狀”稱號

　　? 2014年共青團中國中醫(yī)科學院委員會“青年文明號”

　　? 2013年中華全國婦女聯(lián)合會“巾幗文明崗”稱號

　　? 2012年國家中醫(yī)藥管理局直屬機關“五四紅旗團支部”

　　藥學專業(yè)方面獲得榮譽：

　　? 國家中醫(yī)藥管理局臨床藥學科國家中醫(yī)重點專科培育項目

　　? 北京市中醫(yī)管理局示范中藥房

　　? 北京市藥物警戒站

　　? 北京市藥品不良反應監(jiān)測工作先進單位

　　藥學部的核心理念：

　　施行仁術以盡慈善之義務

　　依照藥典以重病民之生命

藥學部大團圓

                     臨床藥師解疑難                                    調劑細心濟世懷

                             煎藥操作守規(guī)程                                     技能比拼顯風采